साओ पाउलो उन शहरों में शामिल हो गया है जिन्होंने पर्यावरण में मौजूद वायरसों के बारे में वैज्ञानिक ज्ञान के विस्तार में योगदान दिया है। राज्य की राजधानी में एकत्र किए गए नमूनों को एक अंतरराष्ट्रीय जांच के हिस्से के रूप में लगभग 3 हजार सामग्रियों के सेट में शामिल किया गया, जिनका आरएनए वायरस के लिए विश्लेषण किया गया।
इस कार्य के परिणामस्वरूप 54,945 प्रजातियों के वायरस का वर्गीकरण किया गया, जिनमें से लगभग 77% मौजूदा वैज्ञानिक डेटाबेस में अनुपस्थित थे। इस अध्ययन ने 31 देशों के 102 शहरों से सामग्री को एकीकृत किया और UPVAtlas नामक एक कैटलॉग बनाने का मार्ग प्रशस्त किया, जो शहरी और उपनगरीय परिस्थितियों में पाए गए वायरसों को समर्पित है।
नेचर कम्युनिकेशंस पत्रिका में प्रकाशित यह अध्ययन अस्पतालों, परिवहन केंद्रों, बैंकों, अक्सर उपयोग की जाने वाली सतहों, मिट्टी, पानी और अपशिष्ट जल जैसे विभिन्न स्रोतों से नमूनों को शामिल करता था। इसका उद्देश्य किसी विशिष्ट बीमारी पर ध्यान केंद्रित किए बिना इन वातावरणों में वायरसों की उपस्थिति का अवलोकन करना था।
इस तरह की खोज का एक कारण वायरसों के अध्ययन के पारंपरिक दृष्टिकोण में निहित है। एकत्रित ज्ञान का एक बड़ा हिस्सा ऐसे जीवों के आधार पर प्राप्त किया गया है जो पहले से ही विशिष्ट बीमारियों से जुड़े हुए थे। ज्ञात समस्याओं का कारण न बनने वाले वायरसों को कम ध्यान मिलता है।
समझ को गहरा करने के लिए, शोधकर्ताओं ने सीधे नमूनों से निकाले गए आनुवंशिक पदार्थ का विश्लेषण किया। मेटाट्रांसक्रिप्टोमिक्स नामक तकनीक का उपयोग किया गया, जो एक ही समय में उस वातावरण में मौजूद आरएनए अणुओं को अनुक्रमित करने की अनुमति देती है। यह प्रक्रिया लाखों आनुवंशिक खंड उत्पन्न करती है।
वायरल घटकों को अलग करने के लिए, शोधकर्ताओं ने geNomad का उपयोग किया - जो USP के रसायन विज्ञान संस्थान के प्रोफेसर एंटोनियो पेड्रो कामार्गो द्वारा विकसित एक बायोइन्फॉर्मेटिक्स उपकरण है और अध्ययन के लेखकों में से एक भी हैं। अनुक्रमों की तुलना ने वायरसों के समूहों को उजागर किया जो पहले से वर्गीकृत समूहों से काफी भिन्न थे। इसलिए, लेखकों ने दो संभावित नए फाइलम और आरएनए वायरसों के एक नए वर्ग के अस्तित्व का अनुमान लगाया, हालांकि ये वर्गीकरण अभी भी प्रारंभिक हैं क्योंकि वे कंप्यूटर विश्लेषण के माध्यम से निर्धारित किए गए थे।
खोजे गए वायरसों की बड़ी संख्या के बावजूद, लगभग 55 हजार, इसका मतलब शहरों में स्वास्थ्य के लिए नए खतरे का उदय नहीं है। केवल विश्लेषण किए गए अनुक्रमों के लगभग एक तिहाई के लिए संभावित मेजबान का अनुमान लगाया जा सका। परिणामों में 60 वायरस ने मानव संक्रमण की उच्च संभावना प्रदर्शित की, और अन्य 47 अन्य स्तनधारियों में संभावित संक्रमणों से जुड़े थे। सर्वेक्षण ने 166 बैक्टीरियोफेज की भी पहचान की, यानी बैक्टीरिया को संक्रमित करने वाले वायरस।
इसके अलावा, अध्ययन ने दिखाया कि वायरल विविधता वातावरण के आधार पर भिन्न होती है। मिट्टी और तलछट ने उच्च विविधता दिखाई, जबकि शहरी सतहों में कम प्रजाति प्रतिनिधित्व था। अपशिष्ट जल एक अपवाद बन गया और सबसे अधिक विविधता वाले वातावरणों में से एक निकला।
वैज्ञानिकों के लिए, यह कैटलॉग इन वायरल समुदायों की बाद की निगरानी के लिए एक शुरुआती बिंदु के रूप में काम कर सकता है। विभिन्न शहरों और वातावरणों के बीच तुलनात्मक विश्लेषण यह समझने में मदद करेगा कि यह विविधता समय के साथ कैसे बदलती है।