जब ठंडा मौसम या भारी बारिश होती है, तो ट्रेनों में देरी की एक श्रृंखला शुरू हो जाती है। हाल ही में, गुजरात और मुंबई से दिल्ली जा रही ट्रेनों को भारी बारिश के कारण 17 घंटे तक रोका गया था। इसके अलावा, सर्दियों के दौरान कई ट्रेनें कोहरे के कारण देर से चलती हैं। हालांकि, मौसम और बारिश के अलावा, ट्रेनों में देरी के 33 से अधिक कारण हैं, जिनमें से अधिकांश रेलवे के नियंत्रण में हैं।
इन कारणों में से कुछ ऐसे हैं जिनके कारण ट्रेन आधे समय से अधिक देर से चलती है, और इसमें मौसम कारक नहीं होता है। इसलिए यह पता चला कि ट्रेनें सबसे अधिक किस कारण से देरी से चलती हैं।
कुछ साल पहले, रेलवे के शैक्षणिक संस्थान IRITM द्वारा तैयार किए गए CAG ऑडिट के परिणामों पर प्रकाशित एक रिपोर्ट में उल्लेख किया गया था कि आमतौर पर ट्रेनों में देरी के 33 कारण होते हैं, जिसमें खराब मौसम भी शामिल है। हालांकि खराब मौसम वास्तव में बहुत देरी का कारण बनता है, इस रिपोर्ट में बताया गया है कि इन कारणों में से 27 रेलवे के नियंत्रण में हैं, और इनमें से 6 कारण ट्रेनों में देरी के 65-66 प्रतिशत के लिए जिम्मेदार हैं। इस प्रकार, यह निष्कर्ष निकाला जा सकता है कि अधिकांश ट्रेनें इन छह कारणों के कारण देरी से चलती हैं।
एक कारण 'पथ से बाहर निकलना' (Out of Path) है, जब ट्रेन निर्धारित समय या मार्ग पर आगे नहीं बढ़ पाती है और अन्य ट्रेनों को रास्ता देने के लिए रुकने या दूसरे ट्रैक पर स्थानांतरित होने के लिए मजबूर होती है, जिससे देरी होती है।
दूसरे कारण 'इंजीनियरिंग' (Engineering) है, जब ट्रैक, पुलों, संकेतों या अन्य रेलवे बुनियादी ढांचे की मरम्मत और रखरखाव के काम के कारण ट्रेनों की गति कम हो जाती है या उन्हें कुछ समय के लिए रुकना पड़ता है।
'ट्रैफिक' (Traffic) की समस्या भी मौजूद है, जब किसी विशेष मार्ग पर ट्रेनों की अत्यधिक संख्या या परिचालन दबाव के कारण ट्रेनों को संकेतों पर इंतजार करना पड़ता है।
'योजनाबद्ध अवरोध' (Plan Block) का कारण यह है कि मरम्मत या रखरखाव के लिए रेलवे लाइन को पहले से निर्धारित समय के लिए बंद कर दिया जाता है, जिससे गुजरने वाली ट्रेनों में देरी हो सकती है।
'जोन अंतर' (Zone Difference) तब उत्पन्न होता है जब कोई ट्रेन एक रेलवे क्षेत्र से दूसरे रेलवे क्षेत्र में जाती है, और यदि वह पहले क्षेत्र में देरी से पहुंचती है, तो अगला क्षेत्र उसी देरी के साथ ट्रेन का संचालन जारी रखता है।
अंतिम कारण 'पुनर्निर्धारण' (Reschedule) है, जब रेलवे परिचालन कारणों, यातायात, तकनीकी रखरखाव या अन्य परिस्थितियों के कारण ट्रेन के निर्धारित प्रस्थान समय को बदल देता है, जिससे यात्रा का कुल समय पीछे हट जाता है।
ऊपर बताए गए कारकों के अलावा, खराब मौसम, वैगन पकड़ना (chain pulling), असामाजिक तत्वों की कार्रवाई, विरोध प्रदर्शन, दुर्घटनाएं, डीजल और इलेक्ट्रिक इंजनों की खराबी, वैगनों और ट्रेनों की खराबी, ओवरहेड बिजली लाइनों की समस्याएं, नेटवर्क विफलताएं, सिग्नल समस्याएं, पटरी से उतरना (runover) और क्रॉसिंग स्तरों पर समस्याएं भी ट्रेनों में देरी का कारण बन सकती हैं।
