Ученые Центра геномики и биоинформатики Академии наук Республики Узбекистан осуществили впервые полное секвенирование геномов коронавируса на территории страны и провели их последующий биоинформатический анализ. Результаты этого исследования были внесены в международную открытую базу данных вирусных геномов GISAID.
Благодаря этой работе, Узбекистан занял место среди пятидесяти государств мира, которые смогли полностью расшифровать ДНК-последовательности всех вариантов коронавируса, циркулирующих на их территории. Специалисты центра взяли образцы у 62 человек, у которых был подтвержден диагноз, из Управления санитарно-эпидемиологического благополучия и общественного здоровья Ташкентской области и частной клиники Biogen Med.
С помощью секвенатора нового поколения был детально проанализирован 32 образца, что соответствует длине генетической цепочки в 29 903 нуклеотида. Биоинформатический анализ, выполненный с использованием программы Nextclade, позволил сопоставить циркулирующие в республике варианты с глобальной базой данных и определить расположение 18 образцов на филогенетическом древе.
Выявлено, что штаммы относятся к группам GR (20V) и S (19V). Группа GR (20V) на древе находится рядом с вирусами из Европы, Азии, Африки и Австралии, в то время как группа S (19V) объединяет геномы, свойственные азиатскому и африканскому регионам, что свидетельствует о наличии нескольких источников завоза инфекции.
Полная расшифровка геномов COVID-19 и их сравнение с мировыми базами данных заложило основу для непрерывного наблюдения за мутациями вируса в местных условиях. Эти полученные данные имеют решающее значение для создания национальной вакцины, которая будет нацелена на борьбу с теми специфическими штаммами, которые распространяются в Узбекистане.