San-Paulu atrof-muhitda mavjud viruslar haqidagi ilmiy bilimlarni kengaytirishga hissa qoʻshgan shaharlar roʻyxatiga kirdi. Mamlakat poytaxtida yigʻilgan namunalar xalqaro tekshiruv doirasida RNK viruslari uchun tahlil qilingan taxminan 3 ming material toʻplamiga kiritildi.
Ish natijasida 54 945 turdagi viruslar kataloglashtirildi, ularning taxminan 77 foizi mavjud ilmiy maʼlumotlar bazalarida yoʻq edi. Ushbu tadqiqot 31 ta mamlakatdagi 102 ta shahar materiallarini birlashtirdi va shahar va chekka hudud sharoitlarida topilgan viruslarga bagʻishlangan UPVAtlas katalogining yaratilishiga olib keldi.
Nature Communications jurnalida nashr etilgan tadqiqot kasalxonalar, transport tugunlari, banklar, tez-tez ishlatiladigan sirtlar, tuproq, suv va ifloslanish suvlari kabi turli manbalardan olingan namunalarni oʻz ichiga oldi. Maqsad har qanday aniq kasallikka eʼtibor qaratmasdan, bu muhitlarda viruslar mavjudligini kuzatish edi.
Bunday kashfiyotlardan birining sababi viruslarni oʻrganishdagi anʼanaviy yondashuvda yotadi. Toʻplangan bilimlar katta qismi allaqachon maʼlum kasalliklar bilan bogʻliq organizmlar asosida olingan. Maʼlum muammolarni keltirib chiqarmaydigan viruslarga kamroq eʼtibor beriladi.
Tushunchani chuqurlashtirish uchun tadqiqotchilar namunalardan ajratilgan genetik materialni bevosita tahlil qilishdi. Bu yerda meta-transkriptomika deb nomlanuvchi usuldan foydalanildi, u maʼlum bir muhitda mavjud boʻlgan RNK molekulalarini bir vaqtning oʻzida sekventlash imkonini beradi. Bu jarayon millionlab genetik fragmentlarni hosil qiladi.
Virus komponentlarini ajratish uchun tadqiqotchilar USP Kimyoviy instituti professori va tadqiqot mualliflaridan biri boʻlgan Antoniu Pedro Kamargo tomonidan ishlab chiqilgan geNomad — bioinformatik vositasidan foydalanishdi. Sekvensiyalarni solishtirish mavjud kataloglangan viruslardan keskin farq qiladigan virus guruhlarini aniqladi. Shuning uchun mualliflar ikkita potentsial yangi filum va RNK viruslarining yangi sinfi mavjudligi haqida taxmin qilishdi, garchi bu tasniflar hali kompyuter tahlili orqali aniqlanganligi sababli dastlabki boʻlsa ham.
Aniqlangan viruslar soni koʻp boʻlsa-da, taxminan 55 ming dona, bu shaharlarda sogʻliq uchun yangi tahdidlar paydo boʻlishi degani emas. Tahlil qilingan sekvensiyalarning atigi uchdan biri uchun mumkin boʻlgan mezbon taxmin qilinishi mumkin edi. Natijalar orasida 60 ta virus insonni yuqori ehtimol bilan zararlanishiga koʻrsatdi, yana 47 tasi boshqa sutemizuvchilarning mumkin boʻlgan infeksiyalari bilan bogʻliq edi. Tekshiruv shuningdek 166 ta bakteriofag, yaʼni bakteriyalarga zarar yetkazuvchi viruslarni aniqladi.
Bundan tashqari, tadqiqot viruslarning xilma-xilligi muhitga qarab oʻzgarishini koʻrsatdi. Tuproq va choʻkindi katta xilma-xillikni koʻrsatdi, shu bois shahar sirtlarida turdagi vakillik kamroq edi. Ifloslanish suvlari istisno boʻlib, eng katta xilma-xillikka ega muhitlar orasida joylashdi.
Olimlar uchun bu katalog ushbu virus jamoalarini keyingi monitoring qilish uchun boshlangʻich nuqta boʻlishi mumkin. Turli shaharlar va muhitlar oʻrtasida solishtirma tahlil bu xilma-xillik vaqt oʻtishi bilan qanday oʻzgarishini tushunishga yordam beradi.